25 декабря 2017 - Молекулярные биологи из Йеля с помощью компьютерного моделирования создали сверхэффективный препарат, который подавляет работу фермента, помогающему ВИЧ встраивать себя в ДНК клетки, и защитили при его помощи мышей от инфекции, говорится в статье, опубликованной в журнале PNAS. Ученые проводили большую часть экспериментов не на реальных образцах клеток и вирусов, а на их виртуальных аналогах. Используя компьютерные модели различных версий обратной транскриптазы, ученые изучали то, как взаимодействуют с ним различные вещества и лекарства, уже известные науке, и отобрали из них самые эффективные. Открыв несколько десятков таких молекул, способных подавлять работу этого фермента, ученые попытались улучшить их работу, меняя структуру их ключевых элементов, соединяющихся с обратной транскриптазой. Плодом этих усилий стало открытие молекулы, получившей имя "вещество-1", взаимодействующей с вирусом примерно в 2,5 тысячи раз более активно, чем ее прародитель. Добившись подобного результата, ученые синтезировали ее реальный аналог и проверили его работу на культурах иммунных клеток, зараженных ВИЧ, в комбинации с другими антиретровирусными препаратами или в составе особых наночастиц, которые постепенно выделяли "вещество-1" в окружающую среду.
26 июня - В 2016 году произведенные на компьютере белки оказались эффективнее, чем озельтамивир, в спасении мышей от смертельной инфекции. Одна доза дизайнерского белка, вводимого внутренне, была эффективнее 10 доз Тамифлю, препарата, который считается «важнейшим» по мнению ВОЗ из-за его противогриппозного действия. Более того, эти компьютерные антигриппозные белки защищали мышей от самых разных штаммов гриппа. Попытки провести эти многообещающие результаты через одобрение FDA уже предпринимаются. В недавно опубликованной статье в Nature Biotechnology ученые из Института дизайна белка при Вашингтонском университете пошли еще дальше и продемонстрировали новый способ борьбы с гриппом: они использовали компьютерное моделирование для создания совершенно нового вида противовирусных белков, превосходящих возможности человеческого иммунитета...
